Меня интересует, как лабораторная находка становится ответом на врачебный вопрос. Что видно в ткани? Что выросло в посеве? Как следует понимать обнаруженный генетический вариант?
Ткань под микроскопом и в цифровой модели
Я сопоставляю цифровые изображения целых гистологических срезов мелкоклеточного рака лёгкого с пространственными молекулярными данными. Так можно проверить, насколько предсказание модели согласуется с тем, что видно в ткани.
Молекулярная диагностика и генетика рака
Я участвовал в работе о варианте BRCA2, влияющем на сплайсинг, при раке предстательной железы. Другая наша статья посвящена варианту EHBP1 rs721048 и его связи с раком предстательной железы и колоректальным раком в казахской популяции.
Клиническая микробиология
Посев позволяет получить культуру H. pylori, а испытание антибиотиков показывает, к каким препаратам она чувствительна. Так складывается картина устойчивости, с которой сталкиваются врачи в этом регионе.
От предположения к проверке
Изменяя входные данные Geneformer, можно выбрать гены для дальнейшего изучения. Затем нужно проверить, повторяется ли результат у разных доноров, и обратиться к независимым данным тканей.